冷凍干燥機的應用十分廣泛，主要覆蓋了生物工程、醫藥工業(yè)、食品工業(yè)、材料科學(xué)和農副產(chǎn)品深加工等很多領(lǐng)域，尤其是在生物工程和醫藥工業(yè)方面。

　　一、在生物工程領(lǐng)域的應用：

　　在生物技術(shù)產(chǎn)品領(lǐng)域，凍干技術(shù)主要用于血清、血漿、疫苗、酶、抗生素、激素等藥品的生產(chǎn)；生物化學(xué)的檢查藥品、免疫學(xué)及細菌學(xué)的檢查藥品；血液、細菌、動(dòng)脈、骨骼、皮膚、角膜、神經(jīng)組織及各種器官長(cháng)期保存等。

　　二、在醫藥工業(yè)方面的應用：

　　藥品冷凍干燥主要包括西藥和中藥兩部分。西藥冷凍干燥在國內已經(jīng)得到了一定的發(fā)展，很多較大型的制藥廠(chǎng)都有冷凍干燥設備。在針劑方面，冷凍干燥工藝采用的比較多，提高了藥品質(zhì)量和貯存期限，給醫患雙方都帶來(lái)了利益。但目前凍干藥品的品種不多，產(chǎn)品價(jià)格高，干燥工藝不先進(jìn)。在中藥方面，目前還只局限在人參、鹿茸、山藥、冬蟲(chóng)夏草等少量中藥材的凍干，大量的中成藥還沒(méi)有采用凍干工藝，與國外差距較大。日本幾年前就開(kāi)展了“漢藥西制”，改變了中藥的熬制方法，解決了中藥不能制成針劑或片劑的傳統，也解決了中藥不治急病的難題，因此我國中藥凍干工藝及產(chǎn)品的研究很有潛力可挖。

　　冷凍干燥機的凍干制品成海綿狀、無(wú)干縮、復水性好、含水分少，相應包裝后可在常溫下長(cháng)時(shí)間保存和運輸。 由于冷凍式干燥機具有其它干燥方法無(wú)可比擬的優(yōu)點(diǎn)，因此該技術(shù)問(wèn)世以來(lái)越來(lái)越受到人們的青睞，在醫藥、生物制品和食品方面的應用已日益廣泛。血清、菌種、中西醫藥等生物制品多為一些生物活性物質(zhì)，冷凍干燥技術(shù)也為保存生物活性提供了良好的解決途徑。